Команда тайных агентов ЦРУ под руководством Джима Фелпса (Джон Войт) проводит сложную операцию в Праге. Они пытаются завладеть дискетой с секретной информацией. Эти данные так же интересуют мафию.
Тщательно продуманная операция неожиданно проваливается и часть спецагентов погибает.
В живых остался только один - Итан Хант (Том Круз). Руководство ЦРУ возлагает вину за провал на него. Но агент осознает, что это все словно по нотам разыгранная операция.
Итан решает сам найти злополучную дискету и разоблачить заговор, нити которого ведут прямо к высокопоставленным лицам правительства…